創建年代は詳らかではないが、利島村に建立された日蓮宗の寺院であり、利島唯一の仏教寺院とされる。日蓮宗は日蓮聖人（1222〜1282）を宗祖とし、「南無妙法蓮華経」の唱題を修行の根本とする宗派である。伊豆大島を含む伊豆諸島は日蓮聖人の流刑に縁のある地であり、その法華経信仰は伊豆諸島全域に広く伝わった。利島のような小さな離島においても日蓮宗の寺院が根付いたことは、法華経信仰の深さを示している。長久寺は島民の葬儀・年忌法要のみならず、日常的な祈願や子どもたちの教育の場としても機能し、利島の精神文化を担ってきた寺院である。