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糸魚川市にある地質・翡翠専門の博物館。フォッサマグナは日本列島を東西に分ける大地溝帯で、その西端が糸魚川－静岡構造線。館内では日本の大地の成り立ちや糸魚川産翡翠の展示が充実しており、世界最古級の翡翠文化を育んだこの地の地質的・文化的重要性を分かりやすく解説する。縄文時代の翡翠加工品のレプリカや本物の翡翠原石なども展示されている。

1994年に開館。糸魚川は世界で初めて翡翠（ヒスイ）の加工が行われた地とされ、縄文時代から翡翠の産地として知られてきた。フォッサマグナの存在は明治時代にドイツ人地質学者ナウマンによって発見された。