足立区島根に立つ真言宗室生寺派の寺院。奈良・室生寺を総本山とする古義真言の密教修法を受け継ぎ、護摩供養・加持祈祷を通じて島根の旧農村地帯に厄除け・息災延命・五穀豊穣を祈り伝える。

真言宗室生寺派は奈良県宇陀市の室生寺を総本山とし、空海の古義真言宗を源流とする密教の一派である。室生寺は女人高野として知られ、古来より女性の参詣を受け入れてきた。普門寺は足立区島根という古代から農地として利用された低地に建立され、真言密教の護摩修法・加持祈祷を通じて農民の五穀豊穣・厄除けを祈願してきた。島根は荒川の氾濫原に位置するため水害への信仰的対応も寺院の役割の一つであった。近代以降は地域の葬祭・法要を担う菩提寺として機能し、真言の法灯を島根の住宅地に今日まで伝えている。