鯖江市に鎮座する継体天皇ゆかりの古社。継体天皇が越前国に滞在した際にこの地と縁を結んだとされる神社で、古くから越前地方の人々に崇敬されてきた。神社の周辺は「舟津」の地名が示すように、かつて水運に関係した地域であったとされる。継体天皇は越前国出身とも伝えられ、福井県内には継体天皇ゆかりの神社や史跡が点在しており、舟津神社もその重要な一つである。

継体天皇（在位507-531）は第26代天皇で、越前国の男大迹王（をほどのおおきみ）として知られる。越前出身の皇族として即位した継体天皇の足跡は福井県内に多く残り、舟津神社もその一つとされる。古代の越前と皇室のつながりを伝える歴史的な神社である。