五十瀬という水の地名を冠する神社。「五十瀬」は数多くの瀬が連なる豊かな川の流れを意味し、迫川水系の水の恵みに感謝する農民たちが水神として崇め、農業用水と集落の治水を祈願してきた社である。

五十瀬神社は迫川水系の恵みに感謝する水神信仰として創建されたと伝わる。農業用水の安定した供給は農村の生死を左右する問題であり、干ばつ・洪水・水争いに悩まされてきた農民たちが水の神への信仰を深め、社を中心とした水利共同体の精神的な基盤を形成してきた。