伊賀上野城の城山公園内にある、忍者の歴史と技術を体系的に展示する博物館。忍者屋敷として知られる復元古民家には、どんでん返しの戸、隠し階段、抜け穴など、実際の忍者住宅に設けられていた仕掛けが組み込まれ、くノ一姿の案内人が実演しながら解説する。忍者伝承館では伊賀忍者の歴史・起源・日常を学べ、忍具展示室では実際に使われた苦無・手裏剣・まきびしなど約400点の道具を展示。忍者ショーでは本物の手裏剣術や火遁の術が披露され、国内外の観光客に人気。忍者と聞いて伊賀を連想する日本の忍者観光の本丸として世界的に知られる。