小浜市に位置し、「お水送り」の行事で知られる古刹。毎年3月2日に行われるお水送り神事では、神宮寺境内の「閼伽井（あかい）」から汲んだ若狭の水を奈良・東大寺の二月堂に向けて送り出す。10日後の3月12日に行われる東大寺のお水取り（修二会）では、この若狭の水が「お香水」として使用されるという。1200年以上の歴史を持つこの行事は若狭と奈良の深い宗教的つながりを今に伝える。境内には奈良時代の創建にまつわる伝承が残されている。

神亀元年（724年）、若狭彦神社の神願を受けて僧・神叡が開創したと伝わる。東大寺との縁は奈良時代から続き、「遠敷明神が東大寺二月堂の水取りを約束した」という伝説が神宮寺とお水送り神事の起源とされる。現在も毎年3月2日にお水送り神事が行われている。