医療と薬の神を祀る薬師神社は、横手市内において病気平癒・健康長寿を守護する社として地域住民に信仰されてきた。「薬師」の名は仏教の薬師如来に由来するが、神仏習合の時代を経て薬の神・医療の神として神社に祀られるようになった。体の病を抱えた人々や長寿を願う人々が訪れ、回復を願う絵馬が奉納されてきた。

薬師信仰はもともと仏教の薬師如来への信仰であるが、神仏習合の日本において薬師神社として神道的に祀られる例が多数存在する。横手においても江戸時代まで神仏習合の形で薬師の霊験が信仰されてきた。明治の神仏分離令により仏教色が薄められたが、病気平癒の霊験所としての性格は維持された。かつては特定の病に御利益があるとして特別な信仰を集めた時期もあったとされ、近隣から参拝者が訪れる霊験あらたかな社として知られてきた。