三朝町の三朝温泉街の中心に佇む薬師如来を祀るお堂。世界有数のラジウム含有量を誇り放射能泉として名高い三朝温泉の守護仏として古くから信仰を集めてきた。薬師如来は万病を癒す医王仏として知られ、霊泉の効能と仏の加護が重なる三朝の疾病平癒信仰の中心的存在。外湯「株湯」近くに位置する薬師堂は温泉客が入浴前後に参拝する習慣が根付いており、最澄・空海ら高僧ゆかりの薬師信仰が中国地方の山間温泉地に根付いた証として重要。三徳川の河原露天風呂とともに三朝独特の温泉文化の象徴となっている。

三朝温泉は源義朝の重臣・大久保左馬之助が白狼に導かれて発見したという伝説を持つ古湯。薬師堂はその開湯以来、温泉の効能を守護する薬師如来を祀る場として建立されたとされる。ラジウム泉として世界的に注目される以前から、万病に効く霊泉として信仰を集めてきた。