「妙蓮」の名に法華信仰の清らかさを宿す寺院。蓮の花が泥中から咲くように、日本海沿岸の厳しい風土のなかで人々の心に清澄な信仰を育んできた。北前船の船乗りや商人たちの航海安全祈願にも結びついた霊地。

法華系信仰の広まりとともに由利地方に根を下ろしたと伝わる。北前船の寄港地として栄えた本荘湊の商人や船乗りが安全祈願に訪れた歴史を持ち、海陸の人々を結ぶ信仰の場として栄えた。