元和元年（1625年）に青木賢清が創建した長崎の総鎮守で、長崎三社の一つ。毎年10月7〜9日に行われる「長崎くんち」は国の重要無形民俗文化財に指定された豪壮な秋祭りで、龍踊り・傘鉾・オランダ万歳など多彩な演し物が奉納される。高台に鎮座する境内からは長崎港を一望でき、江戸時代の鎖国下における長崎の特殊な国際環境を反映した独自の祭礼文化を今に伝える格式ある社。毎年多くの観光客・参拝者が訪れる長崎を代表する神社。

1625年に青木賢清が創建。江戸幕府が長崎の守護神として整備し、鎖国時代の異国情緒あふれる都市長崎を見守った。