「龍門寺」の名は中国の黄河の故事「登龍門」に由来し、困難を乗り越えた者が成功をつかむ地の象徴。由利本荘市の子吉川を龍門の滝に見立て、出世と開運を願う人々が参詣する。

江戸時代に本荘藩の藩士や商人が立身出世を祈願して詣でた縁起ある寺と伝わる。北前船で財を成した由利の豪商が寄進した灯籠が境内に残るとも言われ、当時の繁栄を物語る。