科野大宮社は「信濃(科野)」という地名の起源とも関わる古代の神社で、創建年代は不詳だが古代の信濃国において重要な祭祀の場として機能していたとされる。「科野」は現在の信濃国(長野県)の古代名であり、この地に鎮座する大宮社はその地名と深く結びついていた。延喜式内社の格式を持つ可能性も指摘されており、古代の国司が崇敬した重要な神社として平安時代以降も信濃の信仰の核をなしてきた。中世には上田地方を拠点とした真田氏・海野氏の崇敬を受け、戦国時代の武田氏・徳川氏の支配下でも地域の氏神としての地位を維持した。明治以降も地域住民の信仰の場として続き、信濃の古代地名の記憶を今に伝える古社として存続している。