神の山（霊山）を祀る神山神社。能代周辺の神聖な山岳に宿る霊力を奉祀した古社で、山と海が交わる能代の地形的特色を体現している。木材産業の発展を支えた山の霊威への感謝と崇敬が根付く産土の社。

神山（神の宿る霊山）を御神体とする古社として能代に鎮座。木材の産地として栄えた能代では、山の霊力への信仰が産業の根幹と結びついており、伐採・製材に従事する人々が山神への崇敬を深めてきた。古来より能代の霊山信仰の中心となってきた。