武水別神社は平安時代の「延喜式」(927年成立)に名神大社として記載される信濃国二宮で、古代から信濃国の政治・文化の中心的な祭祀場として機能してきた。千曲川の豊かな恵みを感謝する水の神への信仰に根ざし、古代の国司が奉幣を行う国家的な神社として崇敬された。中世には在地豪族・国人領主の崇敬を受け、戦国時代には武田氏・上杉氏の双方から信仰された。江戸時代には千曲市の中心的な神社として地域農民の信仰を集め、五穀豊穣・縁結びの御利益でも知られるようになった。明治の近代社格制度のもとでも格式が認められ、今も「二の宮さん」として地域住民に親しまれる信濃の重要な古社である。