創建年代は詳らかではないが、浄土真宗本願寺派の寺院として港区元麻布に建立されたと伝わる。「善正」とは、善く正しく阿弥陀仏の本願を信じ念仏の道を歩むという浄土真宗の信仰姿勢を示す名称とされる。元麻布周辺は江戸時代に武家屋敷が集まった閑静な地域であり、当寺は武家や庶民の信仰と先祖供養を担う寺院として機能してきた。明治以降、元麻布は外国大使館が立ち並ぶ国際色豊かな地区へと変貌を遂げたが、当寺は変容のなかでも浄土真宗の法脈を守り続け、現代においても門信徒の信仰・供養の場として親鸞聖人の教えを伝えている。