足立区皿沼は荒川低地に位置し、かつては「皿沼」の地名が示すように沼沢が点在する湿地帯の農村集落であった。永昌院は「永く昌える」の意を込めた寺名を掲げ、皿沼の農民・住民が長きにわたる繁栄と安寧を祈る精神的拠り所として建立された。荒川沿いの低地では水害・疫病への脅威が常にあり、寺院は現世の苦難を乗り越えるための精神的支柱として住民に深く根付いていた。江戸時代から地域の葬儀・法事を担い、明治・大正・昭和の近代化と戦後の住宅開発を経て皿沼の街並みは変わったが、永昌院は寺域を守り、現代の住民に先祖供養の場を提供し続けている。