滋賀の日吉大社を総本社とする日枝神社の分社で、山の神・農業神として崇められる。石巻周辺の農民が五穀豊穣と村の平安を祈ってきた里の鎮守である。

比叡山の麓に起源を持つ日吉・日枝信仰は全国に広まり、各地の産土神として定着した。石巻の日枝神社も江戸期以降に農漁村の氏神として機能し、祭礼を通じて地域の結束を高めてきた。