「根本の龍」すなわち仏法の根幹を龍に喩えた本龍寺。龍が仏法を守護するという伝統的な信仰を体現し、にかほ市の漁師が海の龍神と仏法の守護を兼ねて信仰してきた寺。

龍王・龍神信仰は海辺の地域に古くから根付いており、仏法の龍と海の龍神が習合する形で本寺は日本海沿岸の漁師の信仰を集め、近世以降に整備されたとみられる。