本駒込は江戸時代、加賀藩下屋敷や柳沢吉保の下屋敷（後の六義園）が置かれた大名屋敷エリアの一角であり、染井は「染井吉野」の故郷として知られる植木職人の集落が栄えた地であった。教元寺はこうした文化的土壌の豊かな本駒込に創建され、近隣の武家・町人双方の信仰を集めた。真宗大谷派（東本願寺）は、阿弥陀如来の絶対的な慈悲によって衆生が救われるという親鸞聖人の教えを基軸とし、難しい修行を必要とせず念仏ひとつで往生できるという平易な教義が江戸の庶民に広く受け入れられた。寺請制度のもと地域住民の戸籍管理も担い、地域共同体の精神的支柱として機能してきた。現代においても法要・聞法の場として本駒込の住民に寄り添う。