今井地区は青梅市の南部に位置し、多摩川の支流沿いに農地と集落が広がる地域である。三柱神社はその名が示すとおり三柱の神々を合祀する社で、地域の守護と厄除けを目的として複数の神霊が祀られている。こうした合祀形式の神社は農村地帯において複数の小社を統合する形で成立することが多く、当社も今井地区の信仰の拠点を集約した形で現在の姿になったと考えられる。江戸時代を通じて農村共同体の産土神として機能し、農業と日常生活の守護を担ってきた。明治以降の合祀政策においても地区の鎮守としての役割を保ち続け、現在も今井の住民が神事を維持している。三柱の神々の御加護が今井地区の歴史とともに積み重ねられてきた社である。