真言智山派に属する三種町の寺院。玉蔵の寺名は宝珠を蔵するという意味を持ち、仏の智慧の光が地域を照らすことを願って名付けられたとされる。農村住民の葬送と先祖供養を担う菩提寺として信仰されてきた。

真言宗智山派の流れをくむ寺院として、近世以降に農村共同体の菩提寺として整備されたとみられる。八郎潟周辺の低湿地開拓を担った農民たちの信仰拠点となり、現在も法要が営まれている。