創建年代は詳らかではないが、新宿区西早稲田の鎮守として地域住民の信仰を集めてきたとされる天祖神社である。天祖神社は天照大御神（あまてらすおおみかみ）を主祭神とし、伊勢神宮を総本社とする信仰体系のもと全国各地に建立されている。西早稲田は神田川沿いに位置し、早稲田大学の近隣にあたる文教地区として知られる。江戸時代には穴八幡宮の門前を中心とした地域で、早稲田周辺は古くから寺社の多い地域として知られていた。当社は地域の産土神として長く住民の崇敬を受け、太陽神の御加護を願う地域の鎮守として今日に至っている。