奈良県吉野郡吉野町丹治114に鎮座する神社。奈良県神社庁に登載される地域の氏神。

吉野水分神社は、奈良県吉野郡吉野町丹治に鎮座する式内大社で、大和四水分神社の一社。主祭神は天之水分大神。文武天皇2年（698年）の『続日本紀』に「芳野水分峰神に馬を奉る」と記されるのが最古の史料で、当初は青根ヶ峰山頂に鎮座し、大同元年（806年）頃に現在地へ遷座したとされる。12世紀には神仏習合により「子守権現」として修験道の霊場となった。豊臣秀吉は文禄3年（1594年）に花見の際に参詣し、後に豊臣秀頼が慶長10年（1605年）に社殿を再建したことで知られる。