真宗大谷派(東本願寺)は親鸞聖人を宗祖とする浄土真宗の一派で、他力念仏「南無阿弥陀仏」を根幹とする。東北地方では戦国期から江戸期にかけて浄土真宗が広く普及し、秋田県内の農漁村でも多くの真宗寺院が創建された。船越は八郎潟と日本海をつなぐ船越水道に面した港町で、内水面漁業と沿岸漁業が盛んであった。善行寺はそうした漁師町の菩提寺として機能し、漁の無事・豊漁を祈る人々とともに歩んできた。真宗の門徒制度のもとで葬祭を担い、盆の棚経や法話を通じて信仰を世代から世代へと伝えてきた。現在も地区の法要・仏事の中心として地域住民に親しまれている。