曹洞宗の寺院で、自性院の院号は人が本来備える仏性・自性を意味する。禅の根本思想である本来の自己への気づきを院名に体現した、潟上市の地域に根ざした菩提寺である。

自性という概念は禅仏教において核心的な教義であり、この院号は創建者の深い禅的境地を反映している。曹洞宗末寺として潟上市の農村共同体に定着し、檀家の葬儀や年忌法要を代々担ってきた。