「客殿」という珍しい社名を持つ神社。社名は参勤交代の宿場や旅人を迎えた客間（客殿）にゆかりがあるとも、神霊を迎え入れる特別な空間を意味するとも伝えられる。横手地域は秋田と宮城を結ぶ街道の沿道にあり、古来より旅人や商人が往来した。旅の安全と地域の平安を守る神として崇敬されてきた社である。

客殿神社の創建は定かでないが、その社名から、旅人を迎える宿場や客殿に関わりの深い社として誕生したと考えられる。江戸時代、横手地域は出羽諸藩の参勤交代路の沿道にあり、各藩の大名行列が往来した。旅の安全を願う信仰が集まり、地域の人々も旅人を守護する神として大切にしてきたと伝えられる。明治以降は地区の鎮守として機能し続け、現在も氏子によって伝統が守られている。