亀戸は亀戸天神社の門前として発展した町であり、梅・藤の季節には江戸時代から多くの参拝客が訪れた風雅な下町である。職人・商人が多く暮らすこの地域では、現世利益を重んじる日蓮宗への信仰が根強く、明治以降に在家向けの教会形式の布教施設が各地に設立された。三尊教会はその流れに沿って創設され、釈迦仏・多宝仏・十方分身仏の三尊を本尊に掲げ、南無妙法蓮華経の題目修行を柱とする。信者が自宅での修行と並行して定期的に集い、法話・御祈願を受ける場として機能してきた。亀戸の活気ある商業地の中に静かに佇み、地域の人々の信仰生活を支え続けている。