代々木は明治以降に急速に都市化した渋谷区の地区で、明治神宮の造営によって宗教的にも重要な地域となった。智韻寺は真言宗智山派の寺院として代々木に根付き、「智慧の韻（ひびき）」という寺号が示すとおり、真言密教の深遠な教えを音楽的なたとえで表現している。真言密教では「法音（ほうおん）」すなわち仏の教えの音声が衆生の心を目覚めさせると説き、これが「智韻」という名に反映されている可能性がある。江戸時代の代々木台地は農業地帯であったが、明治以降の都市化とともに寺院も地域の精神的拠点として発展した。現在は代々木の住宅地に位置し、護摩修法・写経体験などを通じて密教の法縁を地域に広めている。