創建年代は詳らかではないが、浄土真宗本願寺派の寺院として目黒区目黒本町の地に創建されたとされる。「宗導寺」の名は「宗（みのり）に導かれる」という意味を持ち、親鸞聖人の浄土真宗の教えに帰依することを寺号に示したものとされる。浄土真宗は阿弥陀仏の本願力（他力）によって衆生が救われるという「他力本願」の教えを根幹とし、「南無阿弥陀仏」の念仏によって往生を確信する信仰形態をとる。目黒本町周辺は江戸時代から明治にかけて発展した地域であり、当寺は地域住民の葬送・報恩講など浄土真宗の諸行事を担う菩提寺として機能してきた。