天正18年（1590年）、佐竹義宣が江戸氏を攻略すると、吉田城は佐竹領となり重臣・車斯忠（車丹波守）に与えられ、その居館となった。関ヶ原後の出羽転封に反発した斯忠は水戸城奪還を企てるも失敗し、慶長7年（1602年）に磔刑に処された。