長岡京市今里に鎮座する古社。石田家の邸内社を起源とし、向日神社が修理・改築の際の仮宮として機能した歴史を持つ。「赤根」の社名は地名に由来するとされ、天神信仰とともに地域住民の産土神として代々信仰を受け継いできた小社。向日市の向日神社とのゆかりを持つ、乙訓地域の歴史的神社文化の一端を伝える存在。