創建年代は詳らかではないが、三宅島の伊豆地区に鎮座する古社である。「姉川（あねがわ）」という社名は「姉のように慈しみ深い川」を意味し、川の神・水の神を祀る社として古くから信仰されてきた。水は農業と生活に欠かせない資源であり、島内に流れる川や沢の神を祀ることは、伊豆諸島の各島において古くから行われてきた信仰の形である。三宅島の伊豆地区では、嶽比良神社・神沢神社・御祭神社・姉川神社など複数の神社が点在し、それぞれが地域の異なる側面を守護する役割を担っている。姉川神社はその中で水の恵みへの感謝と農業の繁栄を祈る信仰の場として機能してきた。