創建年代は詳らかではないが、長遠寺は真言宗智山派に属し、大田区南馬込の地において古くから地域の菩提寺として機能してきたとされる。真言宗智山派は弘法大師空海の密教を継承し、京都・智積院を総本山とする宗派である。馬込地区は多摩川台地上の農村地帯として江戸時代を過ごし、明治以降に市街地化が進んだ。大正から昭和初期にかけては詩人・作家・画家などの文化人が数多く居住したことで「馬込文士村」と呼ばれ、地域に独特の文化的風土を育んだ。長遠寺はそうした馬込の変遷とともに歩み、現在も地域の人々の精神的支柱として法を伝えている。