慧然寺は臨済宗円覚寺派に属し、鎌倉の円覚寺（1282年、北条時宗が無学祖元を招いて創建）を本山とする禅院である。円覚寺派は鎌倉幕府以来の武家禅の伝統を受け継ぐ法流で、関東に多くの末寺を持つ。「慧然」の院号は「智慧が燃え立つ」状態——煩悩を焼き尽くし悟りが輝く境地——を意味する禅語であり、この寺の精神的指向を端的に表している。深川2丁目の寺町に建つ慧然寺は、富岡八幡宮・深川不動に近接する宗教的な環境のなかで、近隣の武家・商人の菩提を弔う道場として機能してきた。江戸時代から続く深川の寺院文化の一端を担い、関東大震災や戦災を経て復興。現在も深川の静かな寺町に円覚寺の法脈を伝えている。