八王子市裏高尾町の高尾山北麓に位置する臨済宗南禅寺派の禅寺。薬王院への裏参道が通る集落で南禅寺ゆかりの禅風を守り、山麓の菩提所として深い信仰を集めてきた。

裏高尾町は高尾山の北側山麓に広がる集落で、薬王院への裏参道が通り、山岳信仰と禅宗が交差する宗教的環境が形成されていた。寶珠寺は臨済宗南禅寺派の道場として、五山第一の南禅寺の格式と坐禅修行の伝統を高尾山麓に根付かせた。「寶珠」は如意宝珠（願いを叶える宝の珠）を意味し、諸願成就・開運の祈りを象徴している。山麓の清澄な空気の中で村人の精神文化は薬王院信仰とも結びつき、独自の霊場文化を育んできた。