天文6年（1537年）4月、父・朝興の死去によりわずか13歳で家督を継いだ上杉朝定は、迫り来る北条氏に備えて深大寺城を再興・増築した。しかし北条氏綱は深大寺城を素通りして本城・河越城を直接攻撃したため、朝定は松山城へ敗走。深大寺城は軍事的価値を失い、まもなく廃城となった。