神宮寺は宜野湾市普天間に位置する東寺真言宗の寺院で、住所からも明らかなように普天間宮（普天間神宮）と地理的に近接している。普天間一帯は琉球時代から霊地として知られ、普天間宮の洞窟（御嶽）が信仰の核となってきた。神仏習合の思想のもと、隣接する神社と寺院が一体となって地域の精神文化を形成してきた歴史を本寺は体現している。薩摩藩統治期に真言宗が伝来し、明治の神仏分離令後も寺院として独自の法脈を維持した。1945年の沖縄戦では普天間一帯も激戦に晒されたが、戦後に再建されて現在も地域の仏教の拠点として機能している。