東禅寺は、室町時代後期の明応年間(1492〜1501年)頃、1500年前後に創建されたと伝わる曹洞宗の寺院である。波崎は利根川河口と太平洋に面した漁業の地であり、当寺は早くから地域の漁民の菩提寺として機能してきたとされる。江戸時代には曹洞宗の修行道場としての性格を強め、禅の戒律に基づく修行が営まれる一方、漁業に従事する地域住民の海上安全・大漁祈願の信仰拠点としても深く根付いた。明治時代の神仏分離令や廃仏毀釈の波を経てもなお寺院としての法灯を守り続け、地域の信仰を支えた。近代以降は神栖市南部における曹洞宗布教の拠点として機能し、現在も本尊の釈迦如来を中心に坐禅修行と地域の法要を担い続けている。