越後神社が鎮座する越後町の地名は、室町時代に越後守の称号をもつ武家・杉若氏が居住したことに由来する。幕末には丹波篠山藩(青山家)の京屋敷の庭園の中の島の鎮守社として維持され、1300坪を超える広大な屋敷の池に囲まれた形で存続した。明治以降、廣瀬治助(備治)が型紙と色糊を組み合わせた「写し友禅染め」(型友禅)を発明・普及させ、明治21年(1888年)頃に青山家の旧屋敷跡に工場を建設して型友禅の大量生産を開始した。当地の豊富な地下水が型友禅の染色工程に欠かせなかったとされ、以来染色業者の間で「友禅神社」として信仰されるようになった。境内は路地奥の小社ながら、京友禅の発展と深く結びついた歴史をもつ。