天正7年(1579年)、太宰府天満宮の神職が戦国の兵火を避けるため道真の御神像を奉じて上洛し、六条付近に小祠を設けたのが始まり。天正15年(1587年)、大雲院(豊臣秀吉が四条大橋東詰に創建した寺)の鎮守として烏丸二条へ移転。文禄6年(1597年)、秀吉の都市改造命令に伴い現在の四条烏丸付近に遷座した。元治元年(1864年)の禁門の変後の「どんどん焼け」で四条〜烏丸周辺の広大な区域が火に包まれた際、当社周辺だけが炎を免れたという奇跡的な出来事が起こり、以後「火除の神様」として四条烏丸の守護神的存在となった。現在も学業成就・火難除けの御利益を求める参拝者が絶えない。