台東区清川に建つ法華宗（本門流）の寺院。かつての下谷・三ノ輪の境に位置する清川の下町で、「南無妙法蓮華経」の唱題を核とした法華経信仰を守り、地域の菩提寺として代々の供養を担う。

台東区清川一丁目に位置する本性寺は、法華宗（本門流）の寺院として清川の地に根付いてきた。清川は台東区の北東部にあり、かつての下谷と三ノ輪方面の境界に位置する下町で、明治以降は職人が多く集まった地区である。法華宗（本門流）は日蓮聖人（1222〜1282）の法脈を引き継ぎ、本山を大阪・本門寺に置く。「本性」という寺号は法華経において本来の仏性を開顕するという意義を持ち、修行を通じて本来の清浄な本性に帰る信仰を示す。江戸期から地域の菩提寺として機能し、住民の先祖供養と法要を担い続け、現在に至る。