小石川神社の創建年代は明らかでないが、古くから小石川の地に鎮座し、須佐之男命を主祭神として祀る社として地域住民の信仰を集めてきたと伝わる。外堀・神田川に面した地形的要衝に位置することから、水難除けや航海安全の守護社としての役割を担ってきたとされる。中世から近世にかけて、江戸の城下町形成とともに周辺地域の発展が進み、当社もその守護社として崇敬を受けてきたと考えられる。江戸時代には小石川丘陵一帯に寺社が集積し、当社もその一翼を担っていたとされる。明治時代の神仏分離令および近代社格制度の整備に伴い、地域の氏神社・村社として位置づけられたと伝わる。関東大震災(1923年)や第二次世界大戦の戦災を経なが…