永暦元年（1160年）に後白河法皇が紀州熊野の神々を勧請して創建した神社で、「今熊野」の地名の由来となった。後白河法皇は熊野信仰に深く帰依し、熊野詣を多数回行ったことで知られるが、京の地に熊野の神を勧請したのが本社である。境内には樹齢千年ともいわれる大クスノキが茂り、後白河法皇お手植えと伝わる御神木として崇敬されている。熊野権現・伊弉諾尊などを祀り、那智大社・本宮大社と縁の深い関西熊野信仰のネットワークの一端を担う。腰痛守護の神として信仰を集め、腰痛に悩む参拝者が全国から訪れる。泉涌寺・今熊野観音寺とともに今熊野の歴史的聖地を形成する。