勝林山と号する臨済宗南禅寺派の寺院。元和5年（1619年）、徳川家康の政治顧問として「黒衣の宰相」と称された以心崇伝（金地院崇伝、本光国師）が江戸城北の丸に創建し、寛永16年（1639年）に現在地へ移転した。崇伝は京都南禅寺金地院の住職を兼務しつつ、幕政に深く関与。武家諸法度・禁中並公家諸法度・寺院法度の起草に携わり、キリシタン禁教令の発布にも中心的役割を果たした。天海大僧正と並んで徳川幕府の宗教政策を支えた二大僧侶の一人。本尊は聖観世音菩薩。寺領は寛永10年に500石、元禄7年に200石が加増された。昭和新撰江戸三十三観音霊場第28番札所。増上寺・芝東照宮に隣接し、徳川家の信仰圏を構成する重要な寺院。

以心崇伝（1569-1633年）は足利将軍家の一門に生まれ、南禅寺に入って禅を学んだ。慶長14年（1609年）に家康に招かれて以来、外交文書の起草（マカオ事件等）、法令の立案、寺社行政の統括を一手に引き受けた。天海が東叡山寛永寺を拠点としたのに対し、崇伝は南禅寺金地院系を拠点とし、両者は幕府の宗教政策を二分して支えた。崇伝の死後、金地院は幕府との直接的な政治関係は薄れたが、南禅寺派の江戸における拠点寺院としての役割を保ち続けた。