寛永元年（1624年）、長盛法印の開山により永代島に創建された高野山真言宗の寺院。江戸時代には富岡八幡宮の別当寺として深川一帯で指折りの広大な寺院であり、「門前仲町」という地名はまさにこの旧永代寺の門前に由来する。境内では成田山新勝寺の出開帳（出張参拝）が繰り返し催され、これが後の深川不動堂の起源となった。明治初年の神仏分離により廃寺となり、広大な寺域は深川公園や深川不動堂などに変わったが、明治29年（1896年）に旧永代寺の塔頭・吉祥院が名を引き継いで再興。現在は門前仲町駅1番出口すぐの小さな寺院だが、深川の門前町文化を生み出した歴史的な存在として、地域の記憶に深く刻まれている。