百万遍知恩寺の起源は鎌倉時代にさかのぼる。元弘元年（1331年）、京都に疫病が流行した際、浄土宗の僧・善阿空円が百万遍の念仏を修して疫病退散を祈願したとされる。その効験により後醍醐天皇から「百万遍」の号を賜り、寺号に冠するようになったと伝わる。もとは現在地より北方に位置していたとされるが、室町時代以降に現在の左京区田中門前町の地に伽藍が整備されたとされる。浄土宗の大本山として中世・近世を通じて法灯を保ち、徳川幕府の庇護のもとで寺院の体制が整えられた。近世には境内に多くの堂宇が建立・整備され、本尊に釈迦如来を祀り、阿弥陀如来もあわせて安置する形式が定着した。近代以降も浄土宗大本山としての宗教的権…