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下京区下珠数屋町に位置する曹洞宗の寺院。江戸幕府から永平寺・総持寺（曹洞宗両大本山）の京都における「役寺（やくでら）」として公認され、洛中三ヶ寺のひとつとして格式を持つ。書院は桃山時代の建築様式を伝え、狩野永徳に帰せられる障壁画が伝わると伝わる。本尊は釈迦牟尼仏。渉成園（東本願寺飛地境内）に近接する閑静な禅院で、禅宗の学問・修行の場として機能してきた。

創建は江戸時代初期と伝わる。曹洞宗は禅宗諸派の中でも幕府に重用され、宗仙寺は永平寺・総持寺の京都における公式窓口として「役寺」に指定された。洛中に散在する曹洞宗寺院の中でも格式の高い三ヶ寺（洛中曹洞宗三ヶ寺）のひとつとして、参勤交代で上洛する大名や公家との交流拠点ともなった。書院建築は桃山期の様式を残す貴重な遺構とされ、障壁画の作者として狩野永徳（1543–1590年）の名が伝わるが、真偽については諸説ある。渉成園・東本願寺と隣り合う下京の静かな禅院として、現在も地域の禅文化を伝えている。