1945年（昭和20年）3月10日未明、アメリカ陸軍航空隊のB-29爆撃機約300機が東京の下町（墨田・江東・台東など）を焼夷弾で絨毯爆撃した東京大空襲の記憶を継承する施設。マーカス・ミッツァー少将が指揮したこの「ミーティングハウス2号作戦」は、一夜にして推定8万〜10万名の民間人を死亡させ、約26.7万戸を焼失させた。これは広島・長崎の原爆死者に匹敵する、人類史上最大規模の単一空爆による死者数の一つである。被災地域の多くは現在の墨田区・江東区・台東区・江戸川区などに相当する。東京大空襲・戦災資料センターは2002年に民間の寄付によって設立され、生存者の証言・焼夷弾の実物・被害地図などを展示している。東京都平和の日（3月10日）に合わせた追悼行事が毎年行われ、「空襲で亡くなった人々は靖国にも千鳥ケ淵にも祀られていない」という問題提起が今も続く。

昭和45年（1970年）、作家・早乙女勝元らが「東京空襲を記録する会」を結成し資料収集を開始。東京都に公立の空襲資料館建設を求めたが、平成11年（1999年）財政難を理由に計画は凍結された。政治経済研究所と同会が中心となり平成12年（2000年）3月10日から民間募金を開始、4000人超から1億円以上が集まり、平成14年（2002年）3月9日に財団法人政治経済研究所付属博物館として開館。早乙女勝元が初代館長に就任した。